北京病原微生物宏基因组 mNGS 检测
适用人群
病原微生物宏基因组mNGS检测,基于宏基因组高通量测序技术,一次性覆盖31,033种病原体,突破传统培养局限,为重症感染与不明原因发热提供精准分子诊断依据。
适用人群
- 重症肺炎患者经常规抗生素治疗3天无效,需快速明确病原体
- 不明原因发热(FUO)常规检查无明确病因,高度怀疑感染
- 免疫缺陷患者(HIV、化疗后、器官移植)疑似机会性感染
- 中枢神经系统感染脑脊液常规阴性但临床高度怀疑病原体
- ICU复杂感染病情进展迅速,传统培养周期无法满足临床决策
- 疑似罕见或难培养病原体(如分枝杆菌、立克次体、放线菌)感染
检测内容
本检测采用宏基因组高通量测序(mNGS)技术,对临床样本中的全部病原体基因组进行无偏倚测序。技术流程包括样本前处理、核酸提取(DNA+RNA同步)、cDNA合成、片段化、文库构建、高通量测序及生物信息分析。检测范围覆盖31,033种微生物,具体包括:细菌14,208种(含104种分枝杆菌)、真菌814种、病毒15,720种(DNA病毒12,894种+RNA病毒2,826种)、寄生虫169种、支原体/衣原体97种、螺旋体25种。同时检测4,417种耐药基因(覆盖31种抗生素)和484种毒力基因。该技术不依赖病原体分离培养,可检出丰度较低甚至痕量病原体,特别适用于传统检测阴性但临床高度怀疑感染的疑难病例。局限性在于无法区分定植与致病,可能受样本污染影响,且未知或新发病原体可能漏检。
检测流程
样本采集便捷,根据感染部位选择相应类型:外周血、痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、尿液、分泌物等均可。无需空腹,常规采样流程。本地实验室接收样本后,报告周期为3天。支持邮寄样本,具体采样容器及运输条件请咨询客服。对于重症急诊场景,可与实验室确认加急流程,最快24-48小时出报告。
准确性说明
检测准确性依赖于宏基因组测序技术的深度与数据库的完整性。本检测采用自行研发的数据库,涵盖31,033种微生物及4,417种耐药基因,基于《ABX指南》和《临床微生物学手册(第11版)》进行解读。检出结果需结合临床症状、影像学及其他实验室检查综合判断。阳性结果需区分定植、污染与真正病原;阴性结果不能完全排除感染,可能因样本中病原量过低、抗生素治疗后或新发病原体未列入数据库。耐药基因检测可指导抗生素选择,但最终药敏试验仍需传统培养确认。
详细流程
- 临床医生评估患者是否符合mNGS检测适应症,开单申请
- 根据感染部位采集相应样本(血液/痰液/肺泡灌洗液/脑脊液/尿液/分泌物等)
- 样本在{ city }本地或通过冷链物流寄送至检测实验室
- 实验室进行样本前处理(裂解病原细胞壁)及核酸提取(DNA+RNA同步)
- 合成cDNA(将RNA反转录为互补DNA),进行片段化与文库构建
- 采用高通量测序平台进行宏基因组测序,获取海量序列数据
- 生物信息学分析:将测序reads比对至31,033种微生物数据库及耐药基因库
- 专业团队结合临床信息进行报告解读与审核,3天内出具正式报告
检测须知
- 本检测应在临床高度怀疑感染且常规检测阴性时考虑,不作为一线筛查
- 检测结果需结合临床表现、影像学及其他检查综合判读,不可单独诊断
- 检出病原体可能为定植或污染,需由临床医生评估致病性
- 阴性结果不能完全排除感染,需警惕病原量过低或新发病原体
- 样本采集应严格无菌操作,避免污染影响结果准确性
- 抗生素治疗可能影响检出率,但影响程度小于传统培养
- 耐药基因检测结果可指导用药,但最终药敏试验仍需培养确认
- 报告周期为3天,重症急诊可咨询加急流程
北京可做此检测的机构
常见问题
Q: 我发烧一周了,查不出原因,适合做这个检测吗?
A: 您的情况属于“不明原因发热”,非常符合本检测的适用场景。mNGS 能一次性筛查 31,033 种病原体,包括常规血培养和 PCR 查不到的罕见病原,比如立克次体、分枝杆菌等。报告周期仅 3 天,能帮助临床快速锁定病因,尤其适合常规检查阴性但高度怀疑感染的患者。
Q: 我父亲在北京ICU,因重症肺炎上呼吸机,用了多种抗生素没好转,痰培养一直阴性,这个检测能帮上忙吗?
A: 非常适合ICU复杂感染。常规培养在抗生素使用后阳性率显著下降,而mNGS受抗生素影响较小。本检测覆盖31,033种病原体,包括真菌814种、病毒15,720种,还能检出4,417种耐药基因,指导精准用药。报告周期仅3天,比传统培养更快,适合病情进展迅速的重症患者。
Q: 这个检测能发现像新冠、流感这样的RNA病毒吗?
A: 能。本检测采用DNA+RNA同时检测模式,通过cDNA合成步骤将RNA病毒逆转录后进行测序,因此可以检出新冠、流感、HIV等RNA病毒。同时,它也能检出DNA病毒(如巨细胞病毒、EB病毒),覆盖15,720种病毒(含DNA病毒12,894种,RNA病毒2,826种),适合不明原因发热或疑难病例的鉴别诊断。
Q: 我在北京,检出‘耐药基因’但没做药敏,能直接换药吗?
A: 不能直接换药。本检测覆盖4,417种耐药基因(对应31种抗生素),可提示耐药风险,但不等同临床药敏结果。例如检出aph(3')-IIa提示氨基糖苷类耐药,具体用药需医生结合临床、药敏试验综合判断。mNGS是辅助决策,不能替代传统药敏。
Q: 我采样后3天拿到报告,下一步该找谁解读?
A: 报告出具后,建议您首先咨询送检医生,他们会结合您的临床症状、影像学和其他检查结果综合判断。我们的报告解读依据《ABX指南》和《临床微生物学手册(第11版)》,但最终治疗方案需由临床医生决定。如需二次意见,可携带报告到专科医院感染科或呼吸科咨询。